Высший совет по реформам при Президенте Республики Казахстан образован специальным Указом Главы государства от 14 сентября 2020 года. Цель Совета – рассмотрение и утверждение наиболее важных предложений по реформам, инициируемым Агентством и другими государственными органами. Высший Совет по реформам возглавляет Президент страны. В состав Совета также входят Премьер-министр РК, руководители администрации Президента РК, председатели Национального Банка РК, Агентства по стратегическому планированию и реформам, Агентства по развитию и регулированию финансового рынка РК, председатель президиума Национальной палаты предпринимателей «Атамекен». В Совете работают 6 консультативные рабочие группы: в сфере макроэкономики, по диверсификации экономики, по бизнес-регулированию, по социальной политике, по реформе судебной и правоохранительной системе и по реформе по профессиональному Правительству.
Агентство по стратегическому планированию и реформам РК является рабочим органом Высшего Совета по реформам.