На основании совместного приказа Министерства образования и науки Республики Казахстан и Министерства национальной экономики Республики Казахстан «Об утверждении критериев оценки степени риска и проверочных листов по проверкам за системой образования» составляется Список проведения профилактического контроля с посещением за системой образования.
Вузы подпадают под профилактический контроль по расчетам Системы оценки рисков, который проводится для всех вузов вне зависимости от форм собственности.
Список вузов, подлежащих профилактическому контролю на полугодие, размещается на сайте Генеральной Прокуратуры Республики Казахстан. Данный список утверждается приказом Министра образования и науки на основании системы оценки рисков.
При проведении профилактического контроля в случае выявления нарушений требований законодательства в области образования, составляется Предписание с предоставлением срока для устранения нарушений.
По истечении указанного срока проводится внепла новая проверка на контроль исполнения Предписания об устранения нарушений. При выявлении неустранения нарушений вуз привлекается к административной ответственности с приостановлением лицензии на определенный срок.
После завершения срока приостановления лицензии вуза проводится внепла новая проверка на контроль исполнения предписания об устранении грубых нарушений. При повторном выявлении нарушений, формируются административные дела и направляются в суд.