Костанайский городской акимат входит в единую систему исполнительных органов Республики Казахстан, обеспечивает проведение общегосударственной политики исполнительной власти в сочетании с интересами и потребностями развития территории города Костаная.
Акимат — исполнительный коллегиальный орган, возглавляет его аким города Костаная, осуществляющий в пределах своей компетенции местное государственное управление на территории города. Акимат сформирован акимом из заместителей акима, руководителя аппарата и руководителя ГУ «Отдел экономики и бюджетного планирования акимата города Костаная». Акимат города в соответствии с законодательством разрабатывает планы, экономические и социальные программы развития города, бюджет и обеспечивает их исполнение, готовит отчет об исполнении бюджета города.