Структура — ГУ "Отдел экономики и бюджетного планирования района Марқакөл"

Указом Президиума Верховного Совета Казахской ССР от 31 декабря 1964 года было прекращено деление на сельские и промышленные районы. Из Курчумского района во вновь образованный Маркакольский район были переданы: Алексеевский, Бобровский, Буранский, Горновский сельсоветы. Решением Восточно-Казахстанского облисполкома от 12 июля 1967 года № 353 в соответствии с постановлением Совета Министров Казахской ССР от 29 мая 1967 года В 1986 году в состав района вошли 6 сельсоветов: Алексеев, Бобров, Буран, Горный, Караой, Черняев. Указом Президента Республики Казахстан от 23 мая 1997 года Маркакольский район был упразднен в третий раз, территория вошла в состав Курчумского района Восточно-Казахстанской области. Указом Президента РК от 28 декабря 2023 года №424 с 1 января 2024 года Маркакольский район был образован в четвертый раз и выделен из состава Курчумского района.