Фонд музея пополняется через закупку и дарение, результаты археологических и этнографических экспедиций, а также за счет поступлений от государственных учреждений и частных лиц, в соответствии с Положением о создании комиссии по закупке (отбору) фондов в государственных музеях, утвержденным приказом Министра культуры и информации Республики Казахстан № 151-НҚ от 8 апреля 2025 года. Работа по пополнению фонда осуществляется на основании решения специально созданной комиссии по закупке (приему). Комиссия проводит экспертизу предлагаемых экспонатов на предмет их исторической, культурной и научной ценности, подлинности и состояния сохранности, а также соответствия требованиям музейного фонда. По положительному заключению комиссии экспонаты оформляются соответствующими документами, регистрируются, получают инвентарный номер и вносятся в государственный реестр музейного фонда. После этого они размещаются на хранение и используются для научных исследований и экспозиционной деятельности.