МОДО проводилось в форме комплексного тестирования с применением информационно-коммуникационных технологий на языке обучения по трем направлениям функциональной грамотности: в 4 классах - грамотность чтения, математическая грамотность, естественнонаучная грамотность, в 9 классах - математическая грамотность, естественнонаучная грамотность, грамотность чтения (тексты на русском, казахском и английском языках).
Контроль над соблюдением правил проведения МОДО в организациях образования осуществляли уполномоченные представители Министерства просвещения Республики Казахстан, представители института профессионального развития «Өрлеу» и Департамента по обеспечению качества в сфере образования Западно-Казахстанской области.
Комплексное тестирование в школах было проведено в соответствии с правилами, время проведения МОДО нарушений со стороны тестируемых не было.
После проведения тестирования обучающиеся , педагоги и руководители организаций образования прошли анонимное анкетирование для выявления факторов, влияющих на результаты обучения .